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TMT/iTRAQ定量蛋白質組表達譜分析

  • 服務簡介

    iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技術是分別由美國AB Sciex公司和Thermo公司研發的多肽體外標記定量技術。此類技術最多可采用11種穩定同位素標簽,通過特異性標記多肽的氨基基團,然后進行串聯質譜分析,可同時比較多達10種不同樣本中蛋白質的相對含量。

  • 技術原理

    iTRAQ/TMT試劑由三部分組成:報告基團、平衡基團和反應基團。反應基團形成2-10種等質量同位素標簽。iTRAQ/TMT試劑標記酶解后的肽段,可與氨基酸N端及側鏈的伯胺基團發生反應。在一級譜圖中,來自于不同樣本的同一肽段,標記后表現為相同的質荷比。在二級譜圖中,報告基團、平衡基團和反應基團之間的鍵斷裂,帶不同同位素標簽的同一肽段產生質量不同的報告離子,根據報告離子的豐度可獲得樣本間相同肽段的定量信息,再經過軟件處理得到蛋白質的定量信息。其基本原理與技術流程如下圖所示:


     itraq/tmt定量蛋白質組表達譜分析


  • 儀器設備

    Thermo Scientific Q Exactive HF-X

    Thermo Scientific Orbitrap Fusion?Lumos

    Thermo Scientific Q Exactive Plus

    Thermo Scientific Orbitrap Fusion

    Thermo Scientific?Q Exactive


  • 技術優勢

    ? ? ? 平行比較2-10個樣本

    ? ? ? 蛋白通量高,覆蓋度高

    ? ? ? 可用于各種類型生物樣本


  • 應用領域

    ? ? ? 各種脅迫、生理、病理條件下細胞、組織樣品中高通量蛋白表達譜分析

    ? ? ? 各種物種的蛋白質組草圖的構建



  • 參考文獻

    [1]?Yang QS, Wu JH, et al. Quantitative proteomic analysis reveals that antioxidation mechanisms contribute to cold tolerance in plantain (Musa paradisiacal L.; ABB Group) seedlings.?Mol Cell Proteomics. 2012; 11(12): 1853-69.

    [2] Leivonen SK, Rokka A, et al. Identification of miR-193b targets in breast cancer cell and systems biological analysis of their functional impact.?Mol Cell Proteomics.2011; 10(7).

    [3] Xu C, Gao X, et al. The basal level ethylene response is important to the wall and endomembrane structure in the hypocotyl cells of etiolated arabidopsis seedlings.?Mol Cell Proteomics. 2012; 54(7): 434-55.

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