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代謝組學

  • 服務簡介

    從揭示遺傳信息流向的中心法則我們能夠看出:基因組學提供的信息是“可能發生什么”,轉錄組學提供的信息是“即將發生生么”,蛋白質組學提供的信息是“正在發生什么”,代謝組學提供的信息是“已經發生了什么”。

    多維組學的整合能夠從基因表達調控,蛋白翻譯后修飾以及代謝水平,通過多個層面整合分析生物樣本生理或病理變化,實現相互作用網絡構建,揭示相對復雜的疾病發生或生理調控深層次機制。

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    代謝組學是在代謝物層面以非靶向或靶向的方式分析各種生物樣本中的小分子代謝物,通過代謝物相對或絕對定量,實現對體內代謝物水平的檢測。各種生物體代謝調控通路中都需要蛋白質參與造成一些代謝物的形成,因此,在一些處理或者實驗以及疾病發生的研究當中,蛋白水平的變化往往通過代謝調控通路改變了對應的代謝產物含量。

    將蛋白質組學與代謝組學的數據結合起來,通過兩個維度上下游的關聯,實現二者的關聯討論,以蛋白質組學解釋代謝組學差異代謝物產生的通路機制,以代謝組學驗證蛋白質組學數據。應用KEGG數據庫,我能夠將蛋白與代謝共同富集的通路呈現出來。

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    通過KEGG數據庫,實現代謝物水平、蛋白表達水平聯合呈現


    服務項目:

    非靶向代謝組學

    脂質組學

    游離脂肪酸檢測

    膽汁酸全譜分析


    分析內容:

    代謝物總覽,代謝物主成分分析(PCA、OPLS-DA),差異代謝物分析,代謝通路富集分析等;蛋白質組學與代謝組學關聯呈現(個性化分析)


    注:景杰生物代謝組學技術服務由麥特繪譜生物科技(上海)有限公司合作提供。


  • 技術原理

  • 儀器設備

  • 技術優勢

  • 應用領域

  • 參考文獻

    1. Hebert, A.S.,?et al. (2013). Calorie Restriction and SIRT3 Trigger Global Reprogramming of the Mitochondrial Protein Acetylome.?Molecular Cell?49, 186–199.

    2.? Qiu, Y.,?et al. (2014). A Distinct Metabolic Signature of Human Colorectal Cancer with Prognostic Potential.?Clin Cancer Res?20, 2136–2146.

    3. Sadhukhan, S.,?et al. (2016). Metabolomics-assisted proteomics identifies succinylation and SIRT5 as important regulators of cardiac function. Proceedings of the National Academy of Sciences 113, 4320–4325.

    4. Su, M.-A.,?et al. (2014). An Invertebrate Warburg Effect: A Shrimp Virus Achieves Successful Replication by Altering the Host Metabolome via the PI3K-Akt-mTOR Pathway.?PLOS Pathogens?10, e1004196.


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