市場與支持 News

祝賀!林向民組琥珀酰化修飾組學研究發文蛋白質組學領域Top期刊MCP

發布時間: 2019-06-10
瀏覽量: 18
來源:


近日,蛋白質組學Top期刊Mol Cell Proteomics發表了福建農林大學林向民教授團隊琥珀酰化修飾組學的文章,研究揭示賴氨酸琥珀酰化修飾在著名的魚類病原體——嗜水氣單胞菌的生理調控機制。蛋白琥珀酰化修飾組學分析結果表明,琥珀酰化修飾參與多種代謝途徑和生物過程,包括翻譯、蛋白運輸和中心代謝途徑等,在s -核糖同型半胱氨酸裂解酶?(LuxS) 賴氨酸的K23和K30位點琥珀酰化正調控群體感應自誘導因子AI-2的產生,最終改變其與另一病原體溶藻弧菌的競爭力。文章通過對嗜水氣單胞菌琥珀酰化修飾組學的分析,更全面地了解琥珀酰化修飾變化蛋白對重要生理功能,將有助于預防和治療這一重要病原體。文章的第一作者是姚祖杰博士,景杰生物為該研究的蛋白質琥珀酰化修飾質譜檢測提供了技術支持。


祝賀!林向民組琥珀酰化修飾組學研究發文蛋白質組學領域Top期刊MCP

?


眾所周知,大多數蛋白質的翻譯后修飾(PTMs)是動態的、可逆的,對調節各種生物體的細胞生理和病理至關重要。在不同種類的細菌中發現了許多不同的PTMs,包括磷酸化、糖基化、亞硝基化和酰化。其中賴氨酸酰化修飾是細菌中最重要的PTMs之一。與真核生物蛋白一樣,細菌賴氨酸琥珀酰化(Ksucc)在進化上是保守的,并參與核心代謝途徑,包括三羧酸(TCA)循環、糖酵解和丙酮酸代謝。因此,對生物體內Ksucc的全面鑒定對于理解不同生理條件下的基本生物活動和反應機制至關重要。雖然PTM譜已被鑒定為某些細菌種類,如莢膜組織漿菌、副溶血性弧菌和大腸桿菌,但賴氨酸琥珀酰化在原核生物,特別是水生病原體中的功能,在很大程度上仍然未知。


在此,研究人員將高親和純化技術與高靈敏度質譜技術相結合,鑒定了A. hydrophila ATCC7966琥珀酰化修飾。研究結果為賴氨酸琥珀酰化在嗜水桿菌細胞生理學和病理學中的作用提供了重要的見解。


祝賀!林向民組琥珀酰化修飾組學研究發文蛋白質組學領域Top期刊MCP
研究精讀


1、琥珀酰化修飾質譜分析


研究人員采用高親和力純化方法和高特異性琥珀酰賴氨酸抗體對嗜水氣單胞菌賴氨酸琥珀酰化肽收集和富集,用于質譜分析。賴氨酸琥珀酰化序列基序分析表明,不同種類的細菌對底物有共同的偏好。賴氨酸琥珀酰化蛋白的二級結構分析結果表明,賴氨酸琥珀酰化大部分位于結構區域,可能通過二級結構轉換影響蛋白質活性。


祝賀!林向民組琥珀酰化修飾組學研究發文蛋白質組學領域Top期刊MCP

琥珀酰化修飾質譜分析


2、琥珀酰化修飾蛋白功能注釋


為了更好地理解琥珀酰化修飾蛋白在細胞內的功能,研究人員進行了亞細胞定位、生物功能注釋、通路及蛋白互作等分析工作。結果表明,賴氨酸琥珀酰化修飾蛋白主要存在于細胞質中,主要參與核心能量代謝、生物合成、翻譯過程和底物結合等重要功能。PPI分析揭示賴氨酸琥珀酰化參與多種代謝途徑,包括TCA循環、戊糖磷酸途徑、糖酵解/糖異生和丙酮酸代謝。隨后,作者采用Co-IP和Western blotting結合的方法驗證了6個候選蛋白的賴氨酸琥珀酰化,證實了蛋白質組學的琥珀酰化富集結果。


祝賀!林向民組琥珀酰化修飾組學研究發文蛋白質組學領域Top期刊MCP

琥珀酰化修飾蛋白功能注釋


3、LuxS琥珀酰化修飾功能分析


接下來研究人員對調節群體感應分子AI-2合成酶LuxS進行了深入分析。結果表明K23和K30是LuxS琥珀酰化修飾的兩個重要位點, LuxS琥珀酰化修飾正調控該蛋白酶的活性,促進AI-2的合成及其與其它細菌間的交流。鑒于LuxS在細菌的生物學功能中有著多效性的作用,研究人員進一步對Luxs位點突變菌株做了代謝組學分析,用以揭示Ksucc修飾的LuxS是否參與其他代謝途徑。研究結果指出LuxS蛋白酶影響氨基酸、脂肪酸和硫代謝,通過可逆調控其K23、K30位點的琥珀酰化狀態,控制氨基酸、脂肪酸和硫代謝等中心代謝途徑。


祝賀!林向民組琥珀酰化修飾組學研究發文蛋白質組學領域Top期刊MCP

LuxS琥珀酰化修飾功能分析


綜上所述,賴氨酸在蛋白質中的琥珀酰化參與了細菌生理調控,在多種生物過程中起著至關重要的作用。在此,作者研究了A. hydrophila ATCC7966的賴氨酸琥珀酰化譜,以更好地了解賴氨酸琥珀酰化在該魚類和哺乳動物病原體中的調控作用。研究揭示了賴氨酸琥珀酰化修飾s -核糖同型半胱氨酸裂解酶被證明影響細菌群體感應行為,由AI-2介導,可能影響細菌群落相互作用。


此外,賴氨酸的琥珀酰化還參與了幾個中心代謝途徑的調控,包括AMC和氨基酸代謝。文章通過對嗜水氣單胞菌琥珀酰化修飾組學的分析,更全面地了解琥珀酰化修飾變化蛋白的重要生理功能,將有助于預防和治療這一重要病原體。


參考文獻:

1,?Zujie Yao, et al., 2019, Integrated Succinylome and Metabolome Profiling Reveals Crucial Role of S-Ribosylhomocysteine Lyase in Quorum Sensing and Metabolism of Aeromonas hydrophila, Mol Cell Proteomics.


新聞推薦 NEWS
Copyright ?2018-2020 杭州景杰生物科技有限公司
犀牛云提供云計算服務
X
合作
交流
1

QQ設置

3

SKYPE 設置

4

阿里旺旺設置

等待加載動態數據...

等待加載動態數據...

5

電話號碼管理

  • 400-100-1145
6

二維碼管理

等待加載動態數據...

等待加載動態數據...

展開
合作交流
填寫信息,我們的專屬學術顧問將為您解答疑問!
江苏快三计划网大小 云林县| 富源县| 宁明县| 洞口县| 南京市| 西藏| 长丰县| 仙桃市| 石狮市| 广东省| 镇赉县| 始兴县| 东莞市| 金溪县| 巩留县| 家居| 格尔木市| 喀喇沁旗| 克东县| 乐昌市| 沧源| 安远县| 靖安县| 威信县| 噶尔县| 五莲县| 武强县| 昭苏县| 南皮县| 阿鲁科尔沁旗| 太和县| 即墨市| 永定县| 微博| 鹿邑县| 穆棱市| 琼海市| 中卫市|