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新一代4D-LFQ蛋白質組學,17天閃電體驗

發布時間: 2019-05-16
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? ? ? ?近年來,隨著技術的不斷進步,蛋白質組逐步從方法學研究進入到了實際應用階段,并在包括精準醫學在內的各個研究領域中大放異彩。然而相比技術上更加成熟的基因組和轉錄組測序而言,蛋白質組學技術在通量、靈敏度和定量可靠性方面仍然有比較明顯的差距,而這些差距的根本原因,還是在于蛋白質組的復雜度極高,而質譜儀的分離和檢測能力有限。雖然,人們通過一些體外的標記試劑(如TMT/iTRAQ)和采集分析方式(如DIA)試圖在有限的硬件能力上做一些改進,但是仍然不能從根本上來解決問題。

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? ? ? ?令人歡欣鼓舞的是,這個困擾領域多年的問題在近期取得了重大的突破,這就是以新增的“離子淌度“為特征的4D蛋白質組技術的出現。下面,小編就來帶著大家扒一扒什么是“4D蛋白質組”,以及4D蛋白質組能夠帶來哪些改變。

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一.?什么是4D


基于質譜的蛋白質組學研究,其基本原理主要是通過對被測樣品離子的理化性質的測定來進行分析,根據樣品的質量譜圖和相關信息能夠得到定性定量結果。在3D蛋白質組學中,質譜會根據保留時間(retention time)、質荷比(m/z)、離子強度(intensity這三個維度的性質對肽段離子進行鑒定和定量。4D蛋白質組學則是在3D分離的基礎之上增加了第四維度,離子淌度(mobility)的分離(圖1)。離子淌度主要根據離子的形狀和截面進行分離,為復雜體系樣品的測定帶來了更多的可能。


新一代4D-LFQ蛋白質組學,17天閃電體驗

圖1. 4D label-free蛋白質組學


二.?4D的優勢


4D蛋白質組學依托于timsTOF Pro質譜儀,采用PASEF(Parallel Accumulation Serial Fragmentation,同步累積連續碎裂)技術,掃描速度高達100Hz并對低豐度的母離子進行智能疊加選擇,帶來掃描速度革命性的提升(圖2)。



新一代4D-LFQ蛋白質組學,17天閃電體驗?

圖2. PASEF采集循環打破數據采集速度記錄


Tims(Trapped Ion Mobility Spectrometry,捕獲離子淌度)所新增的離子淌度分離,能夠區分m/z差值非常小的共洗脫肽段,從而產生專屬性更高的MS/MS譜圖,使得在3D條件下中被掩蓋的低豐度蛋白信號能夠被區分和識別出來,極大提高檢測靈敏度(圖3)。


?新一代4D-LFQ蛋白質組學,17天閃電體驗

圖3. Tims帶來更高專屬性和靈敏度


在掃描速度和靈敏度大幅度提升的基礎之上,更低的進樣量卻能帶來更深的蛋白組學覆蓋,進一步提高蛋白組學通量,在同等機時和微量樣品的條件下可以多檢測50%-100%的蛋白質或修飾位點。同時,憑借“4D對齊”技術,新一代的label-free定量技術從根本上解決了傳統非標定量隨機性強、缺失值多的問題,定量更加準確。最后,得益于極高的檢測效率,4D蛋白質組技術還能夠大幅壓縮檢測周期,給研究者更快速的體驗。

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三.?4D的應用


介紹了4D label-free蛋白組的基本原理和優勢以后,大家肯定感興趣,和常規的3D蛋白組相比,這如此強大的4D蛋白組到底能應用到哪些研究領域呢? 首先,4D蛋白組基于其速度、靈敏度、通量的提升,能極大的提高常規蛋白質組的檢測,特別適用于臨床蛋白質組學的應用。同時,在一些需要增加靈敏度的應用如蛋白質修飾組學中修飾肽段的富集中,4D蛋白組可以充分發揮其獨特的優勢。最后,對于一些數量有限的待分析樣本如干細胞、免疫細胞等或亞細胞結構,運用4D蛋白組能夠大大提高其鑒定通量。


新一代4D-LFQ蛋白質組學,17天閃電體驗?

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四.?17天極速體驗活動


想不想搶先一步,體驗下4D label-free蛋白質組學更高深度、更加穩定、更快速度的優勢特點呢?我們已于近期開展了閃電體驗17天探索質譜新高度”的活動。

活動內容25個樣本內,17個自然日,閃電體驗(周期從客戶樣本提取質控合格開始計算);

活動時間20195月15-20196月30日;

活動細則:凡在活動期間內簽訂合同并送樣檢測,即可參加本次活動,具體詳情可聯系當地客戶經理。

咨詢電話:400-100-1145

產品介紹:新一代 4D-LFQ蛋白質組學


新一代4D-LFQ蛋白質組學,17天閃電體驗




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